MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011987	GTA	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011987	TAT	2	6	85	90	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011987	A	6	6	787	792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011987	GC	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011987	GCG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011987	CAG	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011987	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011987	CTCC	2	8	5576	5583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_011987	CTAA	2	8	5619	5626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011987	TCT	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011987	CGA	2	6	5644	5649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011987	TTG	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011987	GAT	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011987	ATG	2	6	8300	8305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011987	TCA	2	6	8325	8330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011987	GCGA	2	8	8367	8374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011987	GTGG	2	8	8417	8424	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011987	GAG	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011987	GTC	2	6	8446	8451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011987	GGGA	2	8	9143	9150	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011987	CAA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011987	AC	3	6	9198	9203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011987	AAGC	2	8	9897	9904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011987	TAG	2	6	9913	9918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011987	CG	3	6	9951	9956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011987	CTG	2	6	9960	9965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011987	GCT	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011987	ATTC	2	8	10883	10890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011987	GCG	2	6	12143	12148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011987	AGC	2	6	12330	12335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011987	TCCCC	2	10	12363	12372	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_011987	CGCC	2	8	12384	12391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_011987	GGC	2	6	12429	12434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011987	TGG	2	6	12524	12529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011987	CGC	2	6	12546	12551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011987	GCC	2	6	12641	12646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011987	CCA	2	6	12673	12678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011987	CGG	2	6	12810	12815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011987	CAGC	2	8	12822	12829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011987	GAT	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011987	CG	3	6	12901	12906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011987	GCG	2	6	12922	12927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011987	GTGCA	2	10	12972	12981	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011987	CCG	2	6	12990	12995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011987	CAA	2	6	13370	13375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011987	CCGG	2	8	13378	13385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011987	GTT	2	6	13395	13400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011987	AAT	2	6	13453	13458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011987	TGCC	2	8	13486	13493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011987	GAT	2	6	13509	13514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011987	CAG	2	6	13530	13535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011987	GTTCG	2	10	13542	13551	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011987	CACG	2	8	13557	13564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011987	CGG	2	6	13605	13610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011987	TCG	2	6	13620	13625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011987	AGT	2	6	13631	13636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011987	ACT	2	6	13643	13648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011987	GGA	2	6	13651	13656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011987	CGA	2	6	13675	13680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011987	GC	3	6	13683	13688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011987	AGT	2	6	13810	13815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011987	AGT	2	6	13826	13831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011987	AGT	2	6	13967	13972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011987	AG	3	6	14017	14022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011987	ACG	2	6	16461	16466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011987	TGA	2	6	16551	16556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011987	T	8	8	16562	16569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011987	TGA	2	6	18432	18437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011987	GC	3	6	18560	18565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011987	GC	3	6	18718	18723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011987	CTG	2	6	18731	18736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011987	AGG	2	6	18869	18874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011987	GGCA	2	8	18879	18886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011987	GAA	2	6	18950	18955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011987	GAT	2	6	19497	19502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011987	GCG	2	6	19511	19516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011987	AT	3	6	19585	19590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011987	CG	3	6	19711	19716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011987	TTA	2	6	19786	19791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011987	GCA	2	6	19802	19807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011987	ATT	2	6	19911	19916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011987	AAC	2	6	19926	19931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011987	ATGA	2	8	19962	19969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011987	TCG	2	6	21755	21760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011987	GCG	2	6	21941	21946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011987	CAT	2	6	22103	22108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011987	CG	3	6	22124	22129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011987	GAG	2	6	22231	22236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011987	GCC	2	6	22393	22398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011987	GAC	2	6	22431	22436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011987	CGC	2	6	22440	22445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011987	CGA	2	6	22454	22459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011987	CGTA	2	8	22491	22498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011987	CCCG	2	8	22501	22508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_011987	AT	3	6	24151	24156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011987	CGA	2	6	24239	24244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011987	AGG	2	6	24296	24301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011987	GT	3	6	24665	24670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011987	GGC	2	6	24706	24711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011987	TGTC	2	8	24738	24745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011987	ATT	2	6	24750	24755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011987	GAT	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011987	GTG	2	6	25509	25514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011987	GTG	2	6	26580	26585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011987	AT	3	6	26595	26600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011987	AAAT	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011987	GCC	2	6	26618	26623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011987	TGC	2	6	26639	26644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011987	GATG	2	8	26679	26686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011987	TTGC	2	8	26755	26762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011987	TGA	2	6	27472	27477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011987	CGC	2	6	27519	27524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011987	ACA	2	6	30994	30999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011987	CCG	2	6	31759	31764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011987	T	6	6	31772	31777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011987	TTCT	2	8	31815	31822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011987	GACG	2	8	31829	31836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011987	CAT	2	6	31861	31866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011987	GGC	2	6	31892	31897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011987	C	8	8	32073	32080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_011987	GC	3	6	32081	32086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011987	CAT	2	6	32090	32095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011987	AAG	2	6	32129	32134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011987	AGC	2	6	32168	32173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011987	GTA	2	6	32264	32269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011987	GTG	2	6	32406	32411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011987	CGCCT	2	10	32436	32445	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_011987	TAA	3	9	32483	32491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011987	ACC	2	6	33535	33540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011987	GTT	2	6	36478	36483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011987	GTC	2	6	36577	36582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011987	GAT	2	6	36885	36890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011987	AGG	2	6	36901	36906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011987	ACCG	2	8	36924	36931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011987	GGC	2	6	36961	36966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011987	ATA	2	6	36998	37003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011987	CAT	2	6	37241	37246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011987	CCA	2	6	39155	39160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011987	GTC	2	6	39605	39610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011987	TAT	2	6	39701	39706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011987	GCCG	2	8	39733	39740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011987	GTT	2	6	40568	40573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011987	CGA	2	6	40602	40607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011987	CGC	2	6	42889	42894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011987	CAG	2	6	43015	43020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011987	AG	3	6	43187	43192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011987	AGCG	2	8	43199	43206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011987	CCA	2	6	43255	43260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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150	NC_011987	TA	3	6	43318	43323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011987	GCT	2	6	47215	47220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011987	ATG	2	6	47268	47273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011987	GAC	2	6	47281	47286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011987	CCG	2	6	47301	47306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_011987	GCA	2	6	48790	48795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_011987	TGA	2	6	57122	57127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011987	TCA	2	6	57221	57226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_011987	CGC	2	6	57281	57286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_011987	TGA	2	6	59022	59027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_011987	CTG	2	6	97799	97804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_011987	T	6	6	97819	97824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011987	CGA	2	6	97861	97866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_011987	CCT	2	6	97927	97932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_011987	CCGG	2	8	103340	103347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
288	NC_011987	CCGG	2	8	103361	103368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
289	NC_011987	AAGC	2	8	103375	103382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_011987	TCC	2	6	104408	104413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_011987	TTG	2	6	104442	104447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011987	AAT	2	6	104486	104491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011987	TAAT	2	8	104508	104515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011987	GGC	2	6	104554	104559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_011987	AGC	2	6	104653	104658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_011987	CGG	2	6	105725	105730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_011987	GCT	2	6	105746	105751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_011987	ACG	2	6	111585	111590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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311	NC_011987	ATT	2	6	115597	115602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_011987	ACC	2	6	120728	120733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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322	NC_011987	ATT	2	6	121793	121798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_011987	AT	3	6	121801	121806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_011987	AAT	2	6	121812	121817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_011987	AT	3	6	133927	133932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_011987	GCA	2	6	146461	146466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_011987	TCC	2	6	153840	153845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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412	NC_011987	ATG	2	6	154402	154407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_011987	TCC	2	6	156796	156801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
415	NC_011987	TCGC	2	8	156824	156831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
416	NC_011987	TCC	2	6	158341	158346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
417	NC_011987	AGG	2	6	158358	158363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
418	NC_011987	GACC	2	8	159369	159376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
419	NC_011987	GGC	2	6	159378	159383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_011987	GAG	2	6	159516	159521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
421	NC_011987	CTC	3	9	163789	163797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_011987	CCT	2	6	163853	163858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_011987	ATGCC	2	10	163887	163896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
424	NC_011987	CCT	2	6	167784	167789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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453	NC_011987	CCT	2	6	177731	177736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_011987	CT	3	6	177735	177740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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